小肠平滑肌肉瘤起源于小肠壁的平滑肌组织。国内资料表明，小肠平滑肌肉瘤约占小肠恶性肿瘤的26.2%，仅次于小肠腺癌和恶性淋巴瘤，位居第3位。肿瘤可分布于整个小肠，各段的分布情况各家报道不一，但多数认为发生于空肠者较回肠及十二指肠多见。
小肠扭转是指小肠袢沿其肠系膜纵轴顺时针或逆时针方向扭转超过180°，使扭转肠袢的两端及肠系膜血管均受压，肠管发生完全的或部分的闭塞和血运障碍，从而形成闭袢性绞窄性肠梗阻。小肠扭转发生后是否有肠梗阻的表现还与发生扭转的肠袢长短和扭转的度数有一定的关系。一般而言，扭转的肠袢短小时更容易出现梗阻而肠袢较长时，一般需要扭转180°～360°以上时才会造成梗阻。小肠扭转发生后其系膜也随之发生扭转肠系膜血管被扭曲压迫，影响肠袢的血运，容易发生肠穿孔和腹膜炎。
小肠外瘘是指穿破腹壁与外界相通的肠瘘，以往多因为腹部创伤引起。近年来由于腹部手术范围的扩大、病情的复杂、手术难度的增加以及围术期的放疗、化疗等应用，小肠瘘70%～90%系医源性的，即手术引起的。20世纪60年代其病死率为50%～60%，以后治愈率逐步提高，迄今各治疗中心的治愈率已达80%～90%，这是由于应用了有效的营养支持、重视病人的整体情况和加强监测、维持内稳态的平衡和有效应用抗生素等的结果。但是10%～20%的病死率仍偏高，对这一问题仍需强调预防并进一步提高其疗效。
小肠类癌是起源于肠道黏膜Kulchitsky细胞的肿瘤，Kulchitsky细胞又称肠嗜铬细胞，典型的肠嗜铬细胞内含有分泌颗粒，经重铬酸钾处理后明显地染成黄色，它还有强烈的嗜银性，在甲醛固定后用硝酸银液染色，胞浆内颗粒染成棕黑色。按目前的分类方法，小肠类癌属于分化较好的神经内分泌肿瘤。
由小肠结肠炎耶尔森菌引起的感染，大部分累及胃肠道，引起自限性胃肠炎或肠系膜和末端回肠腺体炎。败血症及其肺和其他内脏受累极少见，肺炎病例一般发生于肝硬化或免疫功能低下的病人。
小肠结肠炎耶尔森菌肠炎是由小肠结肠炎耶尔森菌引起的一种人畜共患感染病。临床表现以急性胃肠炎、小肠结肠炎和败血症等类型为主。亦有急性阑尾炎、脑膜炎、多发性关节炎、猩红热型、黄疸型和淋巴细胞白血病等多种临床类型，部分病例有慢性倾向。
过敏性紫癜是临床上较常见的一种变态反应性出血性疾病，病变主要累及毛细血管壁，临床特点常见为皮肤紫癜，同时也可伴有胃肠道（主要为小肠）、肾脏及关节等器官的症状。因此，小肠过敏性紫癜实际上是过敏性紫癜在胃肠道的临床表现之一。本病可在各年龄组发病，主要发生在2～7岁的儿童，男性较女性多见。
小肠根据形态和结构变化分为三段，分别为十二指肠、空肠和回肠。空、回肠闭锁是新生儿肠梗阻重要原因。空肠闭锁者，见于出生体重偏低者或为早产儿，半数以上属多发性闭锁或苹果皮样（Apple-Peel）闭锁。空肠闭锁有较明显的遗传倾向，双卵孪生儿或同一家族成员中患者较多，并存其他畸形率，较回肠闭锁高。空肠闭锁术后住院时间长，病死率也较高。
难辨梭状芽孢杆菌结肠炎是因使用抗生素导致肠道菌群失调，由难辨梭状芽孢杆菌在肠道大量繁殖引起的肠炎。严重者大便排出片状黏膜，曾称假膜性肠炎，本病由于广泛使用抗生素而日益增多，又称抗生素相关性肠炎，是一种常见的医院内感染性疾病。
急性出血性坏死性肠炎是与C型产气荚膜芽胞杆菌感染有联系的一种急性肠炎，病变主要在小肠，病理改变以肠壁出血坏死为特征。主要临床表现为腹痛、便血、发热、呕吐和腹胀。严重者可有休克、肠麻痹等中毒症状和肠穿孔等并发症。
小肠细菌过度生长（small intestinal bacterial overgrowth）又称小肠淤积综合征、小肠污染综合征或盲袢综合征。是指小肠内菌群数量或菌群种类改变，达到一定程度并引起临床表现者。临床表现包括腹痛、腹胀、腹泻或是吸收不良的表现，如体重下降、贫血、营养不良。引起小肠细菌过度繁殖的病因甚多，而细菌过度繁殖造成小肠吸收不良的机制也甚复杂，仍有许多问题尚未阐明。
肠型放射病在1周左右即出现小肠危象。急性放射病（acuteradiationdisease）是机体在短时间内受到大剂量（1Gy）电离辐射照射引起的全身性疾病。外照射和内照射都可能发生急性放射病，但以外照射为主。外照射引起急性放射病的射线有gamma：线、中子和X射线等。淋巴细胞（主要为脾和淋巴结）的变化规律与骨髓相似，亦以细胞分裂抑制、细胞坏死，减少和出血为主，其发展比骨髓快，恢复亦比骨髓早，但完全恢复需要较长的时间。随着造血器官病变的发展，骨髓型放射病的临床过程有明显的阶段性，可划分为初期、假愈期、极期
小肠在腹腔内占据的位置最大、分布面广、相对表浅、缺少骨骼的保护容易受到损伤。在开放性损伤中小肠损伤率占25%～30%，闭合性损伤中占15%～20%。患者可表现为剧烈的腹痛，伴有恶心、呕吐。查体可见患者面色苍白、皮肤湿冷、脉搏微弱、呼吸急促、血压下降。可有全腹压痛、反跳痛、腹肌紧张等。
小肠液是由小肠粘膜中的小肠腺所分泌。呈弱碱性。成人每日分泌量约1～3L。小肠液边分泌边吸收，这种液体的交流为小肠内营养物质的吸收提供了媒介。小肠液中除水和电解质外，还含有粘液、免疫蛋白和两种酶：肠激酶（能激活胰蛋白酶原，见前文）和小肠淀粉酶。过去认为小肠液中还含有其它各种消化酶，但现已证明，其它各种消化酶并非小肠腺的分泌物，而是存在于小肠粘膜上皮细胞内。它们是分解多肽为氨基酸的几种肽酶以及分解双糖为单糖的几种单糖酶。当营养物质被吸收入上皮细胞内以后，这些消化酶继续对营养物质进行消化。随着绒毛顶端的上皮细胞
小肠扩张：是吸收不良综合征的重要表现，多见于空肠，特别是空肠的中下部，有时可引起包括十二指肠在内的整个小肠扩张。小肠扩张的程度与疾病的轻重有关，扩张的原因是小肠张力低下。有人认为，小肠径大于31mm者即可认为是扩张，明显扩张时肠径可为正常的2~3倍。小肠充气可轻可重，结肠充气多数较显著，常表现为腹周全结肠框充气。小肠充气分布多在结肠框以内的中腹部，扩张重时，肠襻呈连续的管状；扩张轻时，表现为分隔状充气肠管。
低位小肠梗阻是肠梗阻的一种临床表现。肠梗阻（intestinalobstruction，ileus）指肠内容物在肠道中通过受阻。
小肠疝气是一种常见病，其中腹股沟疝是最常见的小肠疝气，男性发病率高于女性。
病证名。指脐下两侧绞痛的疝气。《幼科铁镜》：“婴儿小肠膀胱气痛，在脐下气海两边，筋肿到肾囊边，痛不可抵。”治宜理气消肿，用川楝子、橘核、小茴香、荔枝核俱焙炒为末，白酒调服。甚者宜手术治疗。
小肠俞Xiǎochángshū，出《脉经》。小肠为六腑之一，俞即输注，本穴是小肠之气转输于后背的部位，故名小肠俞。